版本说明

SDAS发版记录

初次发版
- 包含14个功能模块，共31个算法/方法。具体有：数据处理，细胞类型注释，空间结构域识别，细胞邻域分析，CNV分析，空间基因共表达，差异基因识别，基因集富集分析，基因调控网络分析，细胞通讯分析，轨迹分析，转录因子分析，细胞空间距离分析，和公共数据库验证。

问题修复
- 修复基因名称解析 Bug：解决 R 转换 h5ad 时，基因名中横杠 / 下划线被判定为重复的问题，同步更新所有相关模块
- 兼容新版文件格式：修复写入 SAW v8.2+ cellbin 格式 h5ad 的报错，更新所有 anndata 写入模块
- 优化性能与日志：关闭富集模块冗余日志，统一gene_symbol_key处理逻辑并全模块联调
- 细胞注释功能修复
  1. 解决 cell2location 因单元格数量与批次取余为 1 导致运行失败问题
  2. 升级 lightning 至 2.4.0 及以上，修复随机种子日志重复打印问题
  3. 修复 spotlight 标签以数字开头、RCTD 细胞类型含斜线引发的报错
  4. 新增SDAS_LOG_LEVEL/LOG_LEVEL环境变量，支持自定义日志级别
  5. 优化参数校验，错误 GPU 编号等场景不再打印 argparse 使用说明
- 空间基因共表达：修复莫兰指数文件索引读取类型错误导致的格式兼容问题

历史版本信息可以从 GitHub 获取。