安装指南
1. 系统配置最低要求
SDAS分析软件包在Linux系统上被解压和安装,计算环境需满足下列最低要求(无法支持部分分析(如cell2locationGPU模式)):
- 8-core Intel or AMD processor (>24 cores recommended)
- 128GB RAM (>256GB recommended)
- 200G free disk space or higher
- 64-bit CentOS/RedHat 7.8 or Ubuntu 20.04
2. 软件下载
Cloudflare网盘:https://demo.stomicsdb.tech/STOmics_Software_Packages/SDAS/sdas-1.0.1.tar.gz
备注:可以使用wget下载, MD5:dcc69f9b8f2eabfd5ca5d3f688efb427
Github: git clone https://github.com/STOmics/SDAS.git(由于文件大小限制,github上无sdas-1.0.1.tar.gz和h5ad测试数据)
3. 安装
重要提示!!!:解压完成后必须执行setup.sh脚本以确保R路径相关模块正常运行。安装后请勿更改软件安装位置或重命名软件目录,以免导致路径配置失效。
unzip sdas-1.0.1.zip
tar -xzf sdas-1.0.1.tar.gz
cd sdas-1.0.1
sh setup.sh
4. 测试运行
./SDAS -h
5. 其他说明
- 软件压缩包共30G,解压后70G
- 关于GPU使用的说明:请用户自行安装CUDA >= 11.8,参考https://docs.nvidia.com/cuda/cuda-installation-guide-linux/