输入文件示例
h5ad数据格式说明
st.h5ad:空间转录组表达矩阵AnnData对象,要求包含原始表达矩阵、空间坐标等信息。具体请参考SDAS输入数据格式描述。 
莫兰指数文件格式说明(非必须)
./moran.csv:已经计算好的基因莫兰指数文件,(包含了squidpy分析的Moran's I 指数分析的结果,前2列为必需列:与h5ad一致的基因名称和moranI),以逗号分隔,示例内容如下: 
 | 
moranI | 
pval_norm | 
var_norm | 
pval_norm_fdr_bh | 
real_gene_name | 
| ENSG00000164433 | 
0.8273024881077159 | 
0.0 | 
0.0 | 
0.0001022749701474042 | 
FABP5 | 
| ENSG00000106078 | 
0.8203151436536835 | 
0.0 | 
0.0 | 
0.0001022749701474042 | 
STX3 | 
| ENSG00000170260 | 
0.7993499975159156 | 
0.0 | 
0.0 | 
0.0001022749701474042 | 
HSPB1 | 
| ENSG00000163220 | 
0.797949719212986 | 
0.0 | 
0.0 | 
0.0001022749701474042 | 
S100A9 | 
| ENSG00000187021 | 
0.7868677451739036 | 
0.0 | 
0.0 | 
0.0001022749701474042 | 
NTS |