简介

空间转录组CNV分析旨在利用inferCNV工具对空间转录组数据进行拷贝数变异（CNV）推断，帮助揭示组织中不同区域的基因组变异特征。该方法可用于识别肿瘤等组织中的异常细胞亚群，辅助空间异质性研究。

• 适用场景：空间转录组、单细胞转录组的CNV推断与可视化。
• 核心功能：推断每个spot/cell的CNV状态，输出空间热图和相关统计结果。

参考文献

• Patel, A. P., Tirosh, I., Trombetta, J. J., Shalek, A. K., Gillespie, S. M., Wakimoto, H., ... & Bernstein, B. E. (2014). Single-cell RNA-seq highlights intratumoral heterogeneity in primary glioblastoma. Science, 344(6190), 1396-1401.