简介
本模块基于pyscenic分析细胞-基因表达矩阵,预测转录因子(TFs)与靶基因之间的相互作用,结合转录因子活性热图、特异性表达图等,探索转录因子调控网络在细胞亚群中的作用,构建细胞内的基因调控图谱。
参考文献
- Van de Sande, B., Flerin, C., Davie, K., De Waegeneer, M., Hulselmans, G., Aibar, S., ... & Aerts, S. (2020). A scalable SCENIC workflow for single-cell gene regulatory network analysis. Nature protocols, 15(7), 2247-2276.