软件简介

Stereo Data Analysis Solution (SDAS)软件

STOmics开发的一套时空组学数据高级生物信息分析软件，专为时空组学数据（STOmics平台数据）提供全流程数据分析解决方案。

• 功能模块：包含14个功能模块，共31个算法/方法。具体有：数据处理，细胞类型注释，空间结构域识别，细胞邻域分析，CNV分析，空间基因共表达，差异基因识别，基因集富集分析，基因调控网络分析，细胞通讯分析，轨迹分析，转录因子分析，细胞空间距离分析，和公共数据库验证。
• 输入：h5ad文件（如SAW count，SAW convert gef2h5ad生成），SAW aggr生成的h5mu文件，rds文件 输出：h5ad，rds，csv，txt，png和pdf文件
• 输出：h5ad，rds，csv，txt，png和pdf文件